1、難以知曉設定抵押權的情況
有些房地產開發(fā)商由于資金不足，便用建設用地土地使用權到銀行做貸款抵押。以建設用地使用權抵押的，該土地上的建筑物一并抵押。購房人如果不要求辦理土地使用權證，就不容易了解到在土地使用權上設定的抵押，也就無法及時規(guī)避風險。一旦房地產開發(fā)商無力償還銀行貸款，銀行將依法拍賣該土地使用權，并從價款中優(yōu)先受償。而此時房地產購買者的合法權益將很難得到維護。
2、難以發(fā)現開發(fā)商違規(guī)用地的事實
有些開發(fā)商一味追求經濟利益，在建設用地手續(xù)不全甚至沒有建設用地使用權的情況下就進行房地產開發(fā)。購房者不注意辦理土地使用權證，就無法發(fā)現自己購買的是無土地使用權的違規(guī)建筑。此時開發(fā)商或是逃之夭夭或是無力賠償，最后受損失的還是購房者。
3、無法進行二手房交易
《城市房地產管理法》規(guī)定，房地產上市交易，必須出示房屋所有權證和國有土地使用權證。許多業(yè)主在進行二手房交易時，方才想到去找開發(fā)商要求辦理土地使用權證，但此時開發(fā)商多已人去樓空。這就給想要交易的房主帶來了很大麻煩，也影響到了二手房市場的發(fā)展。
4、拆遷補償時會遭受損失
建設部《城市房屋拆遷估價指導意見》第三條規(guī)定，房屋拆遷評估價格為拆遷房屋的房地產市場價格。因此，拆遷補償金不僅包含房屋所有權價值，還包含了土地使用權價值。消費者在購買房地產時，就已經支付了相應的土地使用費。但是購房者如果未辦理土地使用權證，在拆遷過程中就可能得不到關于土地使用權的相應補償。因為沒有土地使用權證，動遷單位就無法確認業(yè)主對土地的合法使用權利。
5、容易遭受意外損失
土地使用權依據用途可以分成住宅用地、工業(yè)用地、福利性項目用地及綜合類性質用地等類別。我們通常購買的商品房都是建造在住宅性用地上。但是近些年興起了一些所謂“單身公寓”、“酒店式公寓”或是商住兩用樓，開發(fā)商以商住兩用或是酒店式管理來吸引購房者，有時卻是給消費者設下的陷阱，因為此類樓盤有些是建設在公共性建設用地上。由于建設用地的用途不同，購買此類房地產會給消費者帶來許多意想不到的損失。諸如，房屋分攤的公共面積較大;交易契稅較普通的住宅樓要高;物業(yè)管理費用較高;按揭貸款的年限較短等。更為重要的是，此類樓盤通常并不認為是住宅，因此一般不允許落戶。所以，購買商品房時，還應關注建設土地用途。