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專利不包括軟件著作權，著作權和專利是兩種不同的知識產權形式。專利和軟件著作權都是知識產權中的一種形式，但是，二者是存在著很大區(qū)別的，但常常有人把專利和軟件著作權看做一種形式。

主要區(qū)別如下：

1、依據的法律不同

軟件的著作權保護依據《著作權法》和《計算機軟件保護條例》。

軟件的專利保護依據《專利法》，具體審查標準參見國家知識產權局專利《審查指南》第二部分第九章“涉及計算機程序的發(fā)明專利申請審查若干問題”。

2、保護原則不同

軟件著作權是在軟件創(chuàng)作完成后自動產生的，也是自愿進行軟件著作權登記，登記的目的是體現(xiàn)公證的效力，主要用于聲明著作權權屬，同時使后續(xù)維權時的證據力度更大。

軟件專利則必須向專利局提出申請才能獲得保護，因此必須要積極申請，且專利制度也是以“用公開換保護”為原則。

3、保護客體不同

軟件著作權申請?zhí)峤坏馁Y料是源代碼及用戶操作手冊，所以軟件著作權保護的是表現(xiàn)形式，不保護思想。

這樣就有可能出現(xiàn)競爭對手將軟件進行研究，然后改變編程語言，達到的結果是一樣的，但由于代碼不相同，所以不侵犯著作權。

軟件專利則不同，在申請時描述的是軟件的設計構思（注意一定要以技術方案的形式表現(xiàn)，或者最好能夠結合硬件來表現(xiàn)），包含了軟件流程圖的內容，而不是主要說明采用哪種程序語言實現(xiàn)。一旦獲權后，他人只要采用了軟件專利的設計構思或方案，就可能構成侵權。

4、申請通過率不同

軟件著作權實行的是登記制，一般不需要經過實質審查，只要形式審查時提交的材料符合要求，并且不違反《著作權法》的規(guī)定即可獲權，登記通過率極高。

軟件專利需要經過形式審查和實際審查。

形式審查主要是審核專利材料是否符合申請要求，形式審查通過后就會公開，再進入實質審查，審核該專利是否符合《專利法》的要求，并且要滿足新穎性，創(chuàng)造性，實用性等諸多要求。

一般純軟件型的專利不易獲權，通過軟硬件結合的方式會提高其授權率，但總得來說通過率依然不高。

綜上所述，專利權與軟件著作權屬于兩種不同的知識產權類別，法律層面上來講，軟件著作權轉讓屬于知識產權技術轉讓這樣描述比較恰當，軟件著作權人可以全部或者部分轉讓其軟件著作權,并有權獲得報酬，而專利權轉讓同樣如此，但是專利權轉讓與軟件著作權的轉讓并沒有從屬關系。