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1、兩者的區(qū)別在于轉(zhuǎn)基因水稻是人類對水稻物種基因進行了干預或?qū)氩煌锓N的基因，導致物種基因?qū)嵸|(zhì)改變，而雜交水稻是人類將不同的水稻品種進行雜交得到的雜種水稻。

2、轉(zhuǎn)基因水稻是指通過轉(zhuǎn)基因技術(shù)將不同品種水稻或近緣物種的抗蟲基因、抗病基因等導入某種水稻基因組內(nèi)培育出的水稻品種。（ps：轉(zhuǎn)基因是基因工程的一種手段，是通過人類的技術(shù)手段將外源DNA整合到載體上（一般是細菌質(zhì)粒），然后由載體將這些外源DNA轉(zhuǎn)入目標細胞的DNA上，讓這些外源DNA和宿主細胞的DNA一起表達產(chǎn)生蛋白質(zhì)，故轉(zhuǎn)基因作物的目的是為了更加高效的育種，同時為了讓作物產(chǎn)量更高，還能簡化農(nóng)業(yè)耕種的程序。以上也是轉(zhuǎn)基因水稻的原理。）

3、雜交水稻是指選用兩個在遺傳上有一定差異，同時它們的優(yōu)良性狀又能互補的水稻品種，進行雜交，生產(chǎn)具有雜種優(yōu)勢的第一代雜交種，用于生產(chǎn)。它的育種思路是選一種各方面性狀都好就某些方面差的品種A，再選一個有一個或幾個性狀好的品種B，讓這兩個品種的性狀正好互補。然后通過雜交，將品種B的控制優(yōu)良性狀的基因傳到品種A上，從而獲得優(yōu)良性狀的后代。